С 1 января 2021 года отменили освобождение от НДС при реализации прав на ПО и базы данных, не включенные в единый реестр российских программ. Дата лицензионного договора не имеет значения.
Даже если договор компания заключила до 2021 года, все равно в 2021 году реализация будет облагаться НДС.
То есть за использование программ в 2020 году клиентам предъявлять НДС не надо. А вот уже с 2021 года идет НДС.
Значение имеет дата передачи прав. Если договор длящийся — это, как правило, последний день месяца. В этот день по 01.01.2021 будет начислен НДС.
Если ПО будет включено в российский реестр, начнется освобождение от НДС.
Такое разъяснение дает Минфин в письме № 03-07-07/5364 от 27.01.2022.