Каждый налоговый агент считает НДФЛ только по тем доходам, что платит сам. Прошлые доходы сотрудников от других агентов нужны только для права на стандартные вычеты.
Разъяснение дает Минфин в письме от 18.08.2022 № 03-04-06/80844.
При реорганизации в форме присоединения последним налоговым периодом для организации является период с 01.01 до дня закрытия в ЕГРЮЛ.
За этот период обязанности по исчислению, удержанию и перечислению НДФЛ возлагаются на такую присоединяемую организацию.
Потом эти обязанности исполняет реорганизованная компания.
Доходы работника, полученные им от присоединяемой организации, организацией-правопреемником не учитываются при исчислении НДФЛ.
Данные об этих старых доходах со старой фирмы в поглотившей ее компании нужны только для одной цели — права на стандартный налоговый вычет. Для этого у сотрудника должна быть справка о доходах (бывшая 2-НДФЛ).