Перечень не облагаемых НДС операций (льгот) перечислен в ст. 149 НК, а также в п. 2 ст. 146 (операции, не признаваемые объектом налогообложения НДС).
На плательщиков УСН распространяются все льготы и освобождения по НДС, перечисленные в этих статьях НК.
Об этом сказано в Методических рекомендациях ФНС по НДС для УСН (пока официально не опубликованы, рассылаются по почте).
ФНС приводит пример: если плательщик УСН оказывает услуги общепита, то НДС он не платит независимо от его доходов. Счета-фактуры по таким операциям тоже не составляет (подп. 38 п. 3 ст. 149 НК).
Источник: https://www.klerk.ru