В письме № СД-4-3/21119@ от 08.11.16 ФНС России разъяснила вопрос уплаты НДС исполнителем госконтракта, применяющим УСН.
В ведомстве напомнили, что плательщики УСН не являются плательщиками НДС и не должны составлять и выставлять покупателям счета-фактуры.
В случае, если в государственном контракте на поставку товаров (работ, услуг) их стоимость указана "с НДС" и при оплате этих товаров (работ, услуг) заказчиком в платежном поручении выделена сумма НДС при невыставлении счета-фактуры у продавца, применяющего УСН, обязанность уплатить НДС в бюджет в соответствии с положениями главы 21 НК РФ не возникает.