В письме от 21 августа 2015 г. № 03-11-11/48495 Минфин напомнил, что в общем случае "упрощенцы" освобождены от уплаты НДС. Однако при выставлении счетов-фактур покупателям у субъектов, применяющих УСН, появляется обязанность по уплате НДС в бюджет.
При этом указанные суммы НДС также включаются в доходы от реализации и облагаются налогом, уплачиваемым в связи с УСН.
С 1 января 2016 года вступают в силу поправки в НК, внесенные законом от 6 апреля 2015 года № 84-ФЗ. Из состава доходов, учитываемых при исчислении налога по УСН суммы НДС, уплаченные налогоплательщикам покупателями товаров, работ и услуг в связи с выставлением счетов-фактур, исключаются.
НДС, уплаченный в составе лизинговых платежей, в соответствии с подпунктом 8 пункта 1 статьи 346.16 НК подлежит включению в состав расходов, учитываемых при определении налоговой базы по УСН.